Un manejo y cuidados posnatales efectivos pueden influir en los resultados posteriores. Las metas del cuidado incluyen: la estabilidad cardiorrespiratoria, la protección de la víscera herniada, el manejo de fluidos, el acceso vascular, la regulación de la temperatura, facilitar la compresión gástrica, la prevención de infecciones y la búsqueda de anomalías asociadas.

Dependiendo del tipo y el tamaño de los defectos asociados, puede haber compromiso pulmonar o cardiaco que requiera intubación inmediata y soporte ventilatorio.

Para minimizar las pérdidas insensibles y el riesgo de infección se debe tapar el defecto con una gasa estéril empapada en suero salino templado y cubrir con un apósito.

Conseguir un acceso vascular lo antes posible es importante para el manejo de fluidos (estos niños tienen pérdidas aumentadas de líquidos y electrolitos). El acceso no debe ubicarse en la vena umbilical y preferiblemente en extremidades superiores. Colocar una sonda oro/nasogástrica facilita la descompresión gástrica y disminuye el riesgo de distensión intestinal.

Una vez el niño esté estable se debe hacer una búsqueda exhaustiva de otros defectos mediante pruebas de imagen (ecocardiograma, ecografía abdominal...).

Un defecto de la pared abdominal grande se relaciona en muchas ocasiones con un menor desarrollo de la cavidad abdominal, lo que dificulta el retorno de las vísceras a su normal posición. Forzar la reintroducción de los órganos al abdomen puede provocar un aumento de la presión intraabdominal dando lugar al síndrome compartimental abdominal. Se ha descrito hasta en el 12% de los casos de defectos de la pared abdominal (onfalocele y gastrosquisis) de mayor tamaño. Clínicamente se manifiesta con problemas respiratorios (patrón restrictivo que precisa picos de presión elevados), congestión hepática aguda con fallo hepático secundario, fallo renal que puede precisar diálisis, infarto intestinal, alteración hemodinámica con descenso del retorno venoso, etc. Para evitarlo se debe controlar la presión intraabdominal durante la intervención. Onfaloceles menores de 5 cm de diámetro no suelen provocar estos problemas, pudiendo realizarse un cierre directo. En cambio, en defecto mayores el retorno de las vísceras en un primer tiempo puede resultar imposible por lo que se debe se puede realizar un cierre por etapas o diferido. Este fue descrito por primera vez por Schuster en 1964. En este caso las vísceras se alojan en un silo temporal de nilón o silastic que se sutura a la fascia. Esto permite la reducción gradual de las asas en 5-9 días, con cirugía correctora posterior. Otras opciones son la colocación de expansores de cavidad abdominal o el cierre de la pared con material protésico sintético o biocompatible, si bien estas estrategias tienen una alta probabilidad de infección.