La mayoría del bicarbonato filtrado se reabsorbe en el túbulo proximal, acoplado a la reabsorción de sodio y con la participación de la anhidrasa carbónica y del cotransportador NBCe1.
Cuando fallan estos mecanismos se produce la acidosis tubular renal proximal o tipo 2.
En los túbulos distales y en los colectores se realiza la regulación final del metabolismo ácido-base, pues a pesar de que en esta sección de la nefrona la reabsorción del bicarbonato filtrado es solamente del 5 al 10%, se produce la secreción de hidrogeniones y la regeneración del bicarbonato consumido.